盗まれた三つのプルトニウムの回収に成功したIMFのエージェント、イーサン・ハント。だが、仲間を救出する際にプルトニウムを再び奪われてしまい、同時核爆発を未然に防ぐ新たなミッションが下される。手掛かりは〝ジョン・ラーク〟という男の名前と、彼が接触する〝ホワイト・ウィドウ〟と呼ばれる謎めいた女の存在のみ。世界に刻一刻と迫る終末の危機。チームの仲間や愛する人までもが危険にさらされ、幾つものフォールアウト（予期せぬ余波）がイーサン・ハントに降りかかる！

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